| 順位 | Team | 勝点 | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失差 |
| 1 | 水戸ホーリーホック | 67 | 35 | 19 | 10 | 6 | 52 | 30 | +22 |
| 2 | Vファーレン長崎 | 63 | 35 | 17 | 12 | 6 | 56 | 42 | +14 |
| 3 | ジェフユナイテッド千葉 | 62 | 35 | 18 | 8 | 9 | 49 | 33 | +16 |
| 4 | RB大宮アルディージャ | 60 | 35 | 17 | 9 | 9 | 55 | 34 | +21 |
| 5 | 徳島ヴォルティス | 58 | 35 | 16 | 10 | 9 | 38 | 21 | +17 |
| 6 | ベガルタ仙台 | 58 | 35 | 15 | 13 | 7 | 45 | 35 | +10 |
| 7 | ジュビロ磐田 | 57 | 35 | 17 | 6 | 12 | 53 | 47 | +6 |
| 8 | サガン鳥栖 | 57 | 35 | 16 | 9 | 10 | 44 | 38 | +6 |
| 9 | いわきFC | 52 | 35 | 14 | 10 | 11 | 54 | 42 | +12 |
| 10 | FC今治 | 52 | 35 | 13 | 13 | 9 | 44 | 38 | +6 |
| 11 | モンテディオ山形 | 46 | 35 | 13 | 7 | 15 | 52 | 50 | +2 |
| 12 | コンサドーレ札幌 | 46 | 35 | 14 | 4 | 17 | 43 | 61 | -18 |
| 13 | ヴァンフォーレ甲府 | 43 | 35 | 11 | 10 | 14 | 36 | 40 | -4 |
| 14 | ブラウブリッツ秋田 | 39 | 35 | 10 | 9 | 16 | 40 | 55 | -15 |
| 15 | 大分トリニータ | 38 | 35 | 8 | 14 | 13 | 26 | 38 | -12 |
| 16 | 藤枝MYFC | 37 | 35 | 9 | 10 | 16 | 39 | 47 | -8 |
| 17 | ロアッソ熊本 | 35 | 35 | 9 | 8 | 18 | 40 | 54 | -14 |
| 18 | レノファ山口FC | 32 | 35 | 6 | 14 | 15 | 32 | 43 | -11 |
| 19 | カターレ富山 | 28 | 35 | 6 | 10 | 19 | 26 | 47 | -21 |
| 20 | 愛媛FC | 21 | 35 | 3 | 12 | 20 | 34 | 63 | -29 |
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