| 順位 | Team | 勝点 | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失差 |
| 1 | アルビレックス新潟 | 45 | 22 | 13 | 6 | 3 | 39 | 18 | +21 |
| 2 | 横浜FC | 43 | 22 | 12 | 7 | 3 | 35 | 26 | +9 |
| 3 | ベガルタ仙台 | 41 | 23 | 12 | 5 | 6 | 41 | 31 | +10 |
| 4 | ファジアーノ岡山 | 36 | 22 | 9 | 9 | 4 | 28 | 19 | +9 |
| 5 | Vファーレン長崎 | 35 | 23 | 10 | 5 | 8 | 26 | 22 | +4 |
| 6 | FC町田ゼルビア | 33 | 22 | 9 | 6 | 7 | 28 | 22 | +6 |
| 7 | モンテディオ山形 | 32 | 22 | 8 | 8 | 6 | 34 | 24 | +10 |
| 8 | 大分トリニータ | 32 | 23 | 8 | 8 | 7 | 31 | 27 | +4 |
| 9 | ジェフユナイテッド千葉 | 31 | 22 | 8 | 7 | 7 | 21 | 19 | +2 |
| 10 | ロアッソ熊本 | 31 | 23 | 7 | 10 | 6 | 29 | 32 | -3 |
| 11 | 水戸ホーリーホック | 30 | 23 | 8 | 6 | 9 | 28 | 26 | +2 |
| 12 | ヴァンフォーレ甲府 | 30 | 22 | 7 | 9 | 6 | 25 | 25 | 0 |
| 13 | 東京ヴェルディ | 29 | 22 | 7 | 8 | 7 | 39 | 36 | +3 |
| 14 | ツエーゲン金沢 | 28 | 22 | 7 | 7 | 8 | 29 | 32 | -3 |
| 15 | ブラウブリッツ秋田 | 27 | 23 | 7 | 6 | 10 | 20 | 30 | -10 |
| 16 | 徳島ヴォルティス | 25 | 22 | 4 | 13 | 5 | 23 | 18 | +5 |
| 17 | レノファ山口FC | 24 | 22 | 6 | 6 | 10 | 23 | 27 | -4 |
| 18 | ザスパクサツ群馬 | 23 | 22 | 6 | 5 | 11 | 19 | 26 | -7 |
| 19 | 栃木SC | 23 | 22 | 5 | 8 | 9 | 15 | 23 | -8 |
| 20 | 大宮アルディージャ | 22 | 22 | 5 | 7 | 10 | 22 | 34 | -12 |
| 21 | グルージャ盛岡 | 22 | 22 | 6 | 4 | 12 | 18 | 38 | -20 |
| 22 | FC琉球 | 15 | 22 | 3 | 6 | 13 | 24 | 42 | -18 |
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