| 順位 | Team | 勝点 | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失差 |
| 1 | 水戸ホーリーホック | 54 | 29 | 15 | 9 | 5 | 45 | 28 | +17 |
| 2 | Vファーレン長崎 | 54 | 29 | 15 | 9 | 5 | 48 | 39 | +9 |
| 3 | ジェフユナイテッド千葉 | 51 | 29 | 15 | 6 | 8 | 40 | 27 | +13 |
| 4 | 徳島ヴォルティス | 48 | 29 | 13 | 9 | 7 | 29 | 17 | +12 |
| 5 | ジュビロ磐田 | 48 | 29 | 14 | 6 | 9 | 44 | 36 | +8 |
| 6 | ベガルタ仙台 | 48 | 29 | 12 | 12 | 5 | 33 | 27 | +6 |
| 7 | RB大宮アルディージャ | 47 | 29 | 13 | 8 | 8 | 39 | 25 | +14 |
| 8 | サガン鳥栖 | 46 | 29 | 13 | 7 | 9 | 34 | 31 | +3 |
| 9 | FC今治 | 43 | 29 | 11 | 10 | 8 | 35 | 30 | +5 |
| 10 | コンサドーレ札幌 | 40 | 29 | 12 | 4 | 13 | 36 | 49 | -13 |
| 11 | いわきFC | 39 | 29 | 10 | 9 | 10 | 44 | 37 | +7 |
| 12 | ヴァンフォーレ甲府 | 38 | 29 | 10 | 8 | 11 | 31 | 30 | +1 |
| 13 | モンテディオ山形 | 35 | 29 | 10 | 5 | 14 | 42 | 41 | +1 |
| 14 | ブラウブリッツ秋田 | 35 | 29 | 10 | 5 | 14 | 39 | 48 | -9 |
| 15 | 藤枝MYFC | 33 | 29 | 8 | 9 | 12 | 35 | 38 | -3 |
| 16 | ロアッソ熊本 | 33 | 29 | 9 | 6 | 14 | 35 | 43 | -8 |
| 17 | 大分トリニータ | 30 | 29 | 6 | 12 | 11 | 23 | 33 | -10 |
| 18 | レノファ山口FC | 25 | 29 | 4 | 13 | 12 | 27 | 37 | -10 |
| 19 | カターレ富山 | 23 | 29 | 5 | 8 | 16 | 22 | 39 | -17 |
| 20 | 愛媛FC | 17 | 29 | 2 | 11 | 16 | 27 | 53 | -26 |
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